CIP清洗系統能保證一定的清洗效果，提高產品的安全性；節約操作時間，提高 效率；節約勞動力，保障操作安全；節約水、蒸汽等能源，減少洗滌劑用量；生產設備可實現大型化，自動化水平高；延長生產設備的使用壽命。CIP清洗的作用機理化學能主要是加入其中的化學試劑產生的，它是決定洗滌效果最主要的因素。
　　酸、堿洗滌劑的優點有：酸洗能通過化學反應去除鈣鹽和礦物油等殘留；堿洗能通過皂化反應去除脂肪和蛋白等殘留。
　　缺點有：水洗性差。
　　滅菌劑的優點有：殺菌效果迅速，對所有微生物有效；不受水硬度影響；在設備表面形成薄膜；濃度易測定；易計量；可去除惡臭。
　　缺點有：有特殊味道；需要一定的儲存條件；不同濃度殺菌效果區別大；氣溫低時易凍結；用法不當會產生副作用；混入污物殺菌效果明顯下降；灑落時易沾污環境并留有痕跡。